Nochmal zur Klarstellung, es kam bei mir nicht genau an. Die GTX 770 und die GTX 550Ti gehen beide einzeln im oberen Slot, soweit bin ich.
Wie sieht es denn mit dem unteren Slot aus, gehen beide Karten auch einzeln in diesem Slot? Vielleicht gibt es ja bloß mit dem zweiten PCI-E x16 Slot Probleme.
Falls das nicht so ist würde ich vielleicht versuchen, beide Karten auszubauen, mit der On-Board-GPU zu booten(falls vorhanden), dann sämtliche Nvidia-Treiber zu deinstallieren und danach wieder beide Karten einzubauen und die Treiber neu aufspielen. Das kannst du natürlich auch im Notfall ohne On-Board-GPU machen, die Windows-Treiber werden dir auch ein Bild geben.
Die Karten selber funktionieren ja erwiesenermaßen beide, es kann also nur an der Software oder möglicherweise am Mainboard (Steckplatz) liegen. Schau dir den Steckplatz einfach mal genau an, vielleicht erkennt man ja einen Defekt.