Habe mich etwas eingelesen und ich denke mal das Problem wird darin liegen, dass durch die Verschlüsselung (und scheinbar den Spaghetti-Code) die Dateien wesentlich länger beim öffnen, schließen und puffern benötigen, was dementsprechend bei z.B. hunderten Dateien die in kurzen Abständen geschrieben und gelesen werden, zu den Laggs führen wird da der PC wesentlich mehr Leistung benötigt um das „schnell“ abzuschließen.
Dadurch ist VeraCrypt auf die Dateien fokussiert und der PC hängt sich kurz auf.